هو برنامج جديد بنظام الساعات المعتمدة يطرحه قسم الميكروبيولوجي وهو البرنامج الوحيد على مستوى الجامعات المصرية، وسيكون خريجو هذا البرنامج مؤهلين للعمل في مجالات الميكروبيولوجيا التطبيقية وإجراء جميع التحليلات الميكروبيولوجية والكيموحيوية والكيميائية والجزيئية في مختلف المجالات (الطبية، الصناعية، البيئية، البحثية، ... إلخ).

ويدرس الطلاب مقررات حديثة مثل: بيولوجيا الخلايا الجذعية، والتكنولوجيا الحيوية التحليلية، وعلم البروتينات والجينومات، والتكنولوجيا الحيوية النانوية، والطب الشرعي الجزيئي، وزراعة الخلايا والأنسجة، والبيولوجيا الحاسوبية والمعلوماتية الحيوية، والهندسة الوراثية والتعبير الجيني، ... إلخ؛ ويُدرس بعض هذه المقررات لأول مرة في كليات العلوم، مثل: مكافحة العدوى والتوحيد القياسي ومراقبة الجودة وتوكيدها.